Kontoret beskæftiger sig med planlægningsopgaver vedrørende fysisk struktur, dimensionering og logistik i forhold til det nye universitetshospital.
I opgaverne indgår også tilrettelæggelse af rokade-/etapeplan i forbindelse med det nye hospitalsbyggeri.
Hertil kommer opgaver vedrørende planlægning af større anlægsprojekter på det eksisterende Aalborg Universitetshospital.
Plan og struktur er, i forhold til de nævnte opgaver, kontaktholder til afdelingsledelser mv. på Aalborg Universitetshospital.